2009年10月国家药监局发出第一张通过互联网向个人消费者提供药品的资格证，不过这一市场的增长规模一直有限。数据显示，2009年中国药品零售市场规模约1500亿元，其中网络销售仅7000万元左右，只占零售市场销售的0.046%；去年中国药品零售市场规模约1739亿元，同比增长17%，网络销售额刚刚过亿元，而美国的网上药品销售规模已接近1700亿美元，占整个药品零售市场的比例接近30%，最大的网上药店CVS的年营业额超过150亿美元，九州通作为全国最大的医药电子商务销售商，在B2B方面的销量也才突破10个亿。

中国的医药在电子商务领域还有很大的发展空间，2011年医药B2C的发展开始发力。腾讯QQ商城引入健客网，淘宝上马“医药馆”试水网上卖药，京东牵手九州通，之后当当也加入其中。越来越多的药品代理商纷纷加入这个电子商务行业。根据SFDA数据显示，我国具有互联网药品交易服务资格的企业共有67家，其中向个人消费者提供药品的B2C模式企业有36家，与其他企业进行药品交易的B2B模式有23家，第三方交易服务平台模式有8家。

医药电子商务的发展主要面临以下问题：

首先是政策壁垒。相关部门坚持一种宁缺毋滥的原则，这是医药企业做电商目前的最大障碍。根据《互联网药品交易服务审批暂行规定》，只有同时具备《互联网药品交易服务资格证》和《互联网药品信息服务资格证》两证的企业才能开展网络售药。但对于只提供第三方交易平台的电子商务企业，《互联网药品交易服务审批暂行规定》并未指明是否需要同时具备双证才能售药，京东商城与九州通当初的合作也是利用了这个漏洞。

其次，医药B2C市场还面临物流配送障碍。根据我国《药品管理法》的规定，药品作为关系到人民生命安全的特殊商品，不允许邮购。如果委托第三方配送，其必须通过GSP认证。医药电子商务企业通常不具备此资质，也不具备与之配套的物流中心，需要与符合GSP要求的、拥有先进物流技术和设备的医药物流公司合作，要建立相应的配送网点，配备专业的医药配送人员，进行点对点的配送并提供药学服务。

最后是消费者是否信任的问题。对于关系到身体健康的产品，人们更愿意在医院和药店获得。代理商挑选品牌及产品时不清楚究竟哪种市场大、价格便宜、品牌和质量过关。所以，企业应当建立起自己的品牌，增强用户对自己的信誉度。

医药电子商务的发展需国家从政策层面松绑，加强对网络售药的全过程监管，尽快通过线上线下相结合的方式，实现信息流、商流、资金流、物流的一体化、电子化和网络化，并从价格竞争过渡到差异化商品和相关药学服务的竞争。其中，保健品领域可能会成为医药电子商务的一大增长点。